htscodecs

htscodecs

C library for custom compression for CRAM and other formats

htscodecs provides an API to access CRAM codecs used for "EXTERNAL" block types. These consist of two variants of the rANS codec (8-bit and 16-bit renormalisation, with run-length encoding and bit-packing also supported in the latter), a dynamic arithmetic coder, and custom codecs for name/ID compression and quality score compression derived from fqzcomp.

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Distributionen

openSUSE Tumbleweed

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openSUSE Leap 16.0

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SLFO 1.2

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openSUSE Backports for SLE 15 SP7

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openSUSE Backports for SLE 15 SP4

Nicht unterstützte Distributionen

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